Валенсия была основана 5 марта 1919 года, группой футболистов, которые собралась в баре на Барселонской улице, чтобы придумать альтернативу упраздненному "Клубу Валенсия". Сначала "летучие мыши" проводили свои домашние матчи в валенсийском районе Альхирас.
В 1923 году Валенсия переезжает на Месталью и благодаря успехам на уровне регионов получает право на участие в Кубке Короля Испании. Под конец 20-х годов "летучие мыши" пробиваются во второй футбольный дивизион, а в 1931-м году они уже начнут в элите испанского футбола. В 1934-м "Валенсия" доходит до финала Кубка Короля Испании, где уступает мадридскому Реалу.
Расцвет "Валенсии" пришел на 40-е годы, когда во главе клуба обосновался президент Луис Касанова. В те годы домашняя Месталья, которая была восстановлена после Гражданской войны, увидела много ярких и громких побед. В составе с легендарными Эдмундо Суаресом и Эпифанио Фернандесом "летучие мыши" трижды победали в чемпионате Испании - в 1942, 1944 и 1947 годах, а в 1941 и 1949 завоевывали Кубок страны.
После тех успехов Валенсия немного отходит в тень, а очередного крупное достижение "летучих мышей" связано с приходом на пост главного тренера Альфредо ди Стефано, пришлось ждать более 20-ти лет. С первой же попытки он приводит своих подопечных к национальному титулу, который Валенсия завоевывает в последнем туре. Следующий трофей Валенсии Кубок Испании 1979 года. Спустя год с Арсеналом в финале Кубка УЕФА Валенсия пополнила свою коллекцию первым европейским трофеем. В 1986-м году клуб выступал уже совсем в другой компании - впервые за 56 лет Валенсия играла во втором дивизионе.
Новый расцвет "летучих мышей" пришел на перепутье тысячелетий. В 1999 году команда победила в Кубке Испании, а в 2002 и 2004 годах вместе с Рафаэлем Бенитесом становится победителем Примеры. Валенсия дважды пробивались в финал Лиги Чемпионов, но оба раза неудачно - в 2000 году команда проиграла Реалу, а на следующий год - Баварии. Но в финале Кубка УЕФА 2003/04 "летучие мыши" одолели французский Марсель со счетом 2:0. В 2008-м году Валенсия в седьмой раз отвезла в свой музей Кубок Испании.
